Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpb2Q9CQI7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms