Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms