Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE0

Rnf138, E3 ubiquitin-protein ligase RNF138, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138Q9CQE0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms