Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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