Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rab5aQ9CQD1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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