Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Med4Q9CQA5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Med4Q9CQA5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Med4Q9CQA5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Med4Q9CQA5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Med4Q9CQA5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Med4Q9CQA5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Med4Q9CQA5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Med4Q9CQA5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Med4Q9CQA5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Med4Q9CQA5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Med4Q9CQA5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Med4Q9CQA5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Med4Q9CQA5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Med4Q9CQA5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Med4Q9CQA5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Med4Q9CQA5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Med4Q9CQA5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Med4Q9CQA5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Med4Q9CQA5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Med4Q9CQA5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Med4Q9CQA5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Med4Q9CQA5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Med4Q9CQA5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Med4Q9CQA5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms