Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ82

Itgb3bp, Centromere protein R, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3bpQ9CQ82 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms