Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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Chmp3Q9CQ10 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
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Chmp3Q9CQ10 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Chmp3Q9CQ10 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Chmp3Q9CQ10 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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Chmp3Q9CQ10 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chmp3Q9CQ10 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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Chmp3Q9CQ10 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
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Chmp3Q9CQ10 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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Chmp3Q9CQ10 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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Chmp3Q9CQ10 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chmp3Q9CQ10 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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