Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms