Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd3Q99PL7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms