Protein–RNA interactions for Protein: Q99P81

Abcg3, ATP-binding cassette sub-family G member 3, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg3Q99P81 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcg3Q99P81 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcg3Q99P81 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcg3Q99P81 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcg3Q99P81 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcg3Q99P81 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcg3Q99P81 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcg3Q99P81 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcg3Q99P81 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcg3Q99P81 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcg3Q99P81 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcg3Q99P81 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcg3Q99P81 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcg3Q99P81 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcg3Q99P81 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcg3Q99P81 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcg3Q99P81 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcg3Q99P81 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcg3Q99P81 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcg3Q99P81 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcg3Q99P81 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcg3Q99P81 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcg3Q99P81 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcg3Q99P81 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcg3Q99P81 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcg3Q99P81 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcg3Q99P81 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcg3Q99P81 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcg3Q99P81 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcg3Q99P81 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcg3Q99P81 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcg3Q99P81 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcg3Q99P81 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcg3Q99P81 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcg3Q99P81 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcg3Q99P81 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcg3Q99P81 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcg3Q99P81 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcg3Q99P81 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Abcg3Q99P81 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Abcg3Q99P81 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Abcg3Q99P81 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcg3Q99P81 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms