Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH7

Slc26a5, Prestin, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc26a5Q99NH7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc26a5Q99NH7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc26a5Q99NH7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc26a5Q99NH7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc26a5Q99NH7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc26a5Q99NH7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc26a5Q99NH7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc26a5Q99NH7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc26a5Q99NH7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc26a5Q99NH7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc26a5Q99NH7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc26a5Q99NH7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc26a5Q99NH7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc26a5Q99NH7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc26a5Q99NH7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc26a5Q99NH7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc26a5Q99NH7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc26a5Q99NH7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc26a5Q99NH7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc26a5Q99NH7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc26a5Q99NH7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc26a5Q99NH7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms