Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atoh8Q99NA2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms