Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SrrtQ99MR6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms