Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtprtQ99M80 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
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