Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdk5rap3Q99LM2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdk5rap3Q99LM2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms