Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcf2Q99LE6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcf2Q99LE6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcf2Q99LE6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms