Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pagr1aQ99L02 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms