Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TriobpQ99KW3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms