Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms