Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf19Q99KP6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms