Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ciao1Q99KN2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ciao1Q99KN2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ciao1Q99KN2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ciao1Q99KN2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ciao1Q99KN2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ciao1Q99KN2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ciao1Q99KN2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ciao1Q99KN2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ciao1Q99KN2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ciao1Q99KN2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms