Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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TrabdQ99JY4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TrabdQ99JY4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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