Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Ddb2Q99J79 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Ddb2Q99J79 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Ddb2Q99J79 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Ddb2Q99J79 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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