Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tspan1Q99J59 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms