Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms