Protein–RNA interactions for Protein: Q923E4

Sirt1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sirt1Q923E4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sirt1Q923E4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sirt1Q923E4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sirt1Q923E4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sirt1Q923E4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sirt1Q923E4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sirt1Q923E4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms