Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms