Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prpf3Q922U1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms