Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tubb6Q922F4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms