Protein–RNA interactions for Protein: Q921I2

Klhdc4, Kelch domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc4Q921I2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhdc4Q921I2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhdc4Q921I2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhdc4Q921I2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhdc4Q921I2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhdc4Q921I2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhdc4Q921I2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhdc4Q921I2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhdc4Q921I2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhdc4Q921I2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhdc4Q921I2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhdc4Q921I2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhdc4Q921I2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhdc4Q921I2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhdc4Q921I2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhdc4Q921I2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhdc4Q921I2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhdc4Q921I2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhdc4Q921I2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhdc4Q921I2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhdc4Q921I2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhdc4Q921I2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhdc4Q921I2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhdc4Q921I2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhdc4Q921I2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhdc4Q921I2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhdc4Q921I2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhdc4Q921I2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhdc4Q921I2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhdc4Q921I2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhdc4Q921I2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhdc4Q921I2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhdc4Q921I2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhdc4Q921I2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhdc4Q921I2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhdc4Q921I2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhdc4Q921I2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhdc4Q921I2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhdc4Q921I2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhdc4Q921I2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhdc4Q921I2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhdc4Q921I2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhdc4Q921I2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms