Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smarca5Q91ZW3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smarca5Q91ZW3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smarca5Q91ZW3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smarca5Q91ZW3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smarca5Q91ZW3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smarca5Q91ZW3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smarca5Q91ZW3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Smarca5Q91ZW3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smarca5Q91ZW3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smarca5Q91ZW3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smarca5Q91ZW3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smarca5Q91ZW3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smarca5Q91ZW3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smarca5Q91ZW3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smarca5Q91ZW3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Smarca5Q91ZW3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smarca5Q91ZW3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Smarca5Q91ZW3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Smarca5Q91ZW3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smarca5Q91ZW3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smarca5Q91ZW3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smarca5Q91ZW3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarca5Q91ZW3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms