Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atl3Q91YH5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms