Protein–RNA interactions for Protein: Q91WL6

Snx11, Sorting nexin-11, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx11Q91WL6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Snx11Q91WL6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx11Q91WL6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms