Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csde1Q91W50 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms