Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp3Q91W36 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms