Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms