Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms