Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps4aQ8VEJ9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps4aQ8VEJ9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms