Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rprd1aQ8VDS4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rprd1aQ8VDS4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rprd1aQ8VDS4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rprd1aQ8VDS4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms