Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCZ8

Rpusd1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd1Q8VCZ8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd1Q8VCZ8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms