Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCG9

Rfxap, Regulatory factor X-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxapQ8VCG9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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