Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC31

Ccdc9, Coiled-coil domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9Q8VC31 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc9Q8VC31 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc9Q8VC31 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc9Q8VC31 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc9Q8VC31 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc9Q8VC31 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc9Q8VC31 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc9Q8VC31 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc9Q8VC31 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc9Q8VC31 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc9Q8VC31 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc9Q8VC31 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc9Q8VC31 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms