Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW8

Ttc36, Tetratricopeptide repeat protein 36, mousemouse

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc36Q8VBW8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc36Q8VBW8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc36Q8VBW8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc36Q8VBW8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc36Q8VBW8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc36Q8VBW8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc36Q8VBW8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc36Q8VBW8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc36Q8VBW8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc36Q8VBW8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc36Q8VBW8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc36Q8VBW8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc36Q8VBW8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc36Q8VBW8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc36Q8VBW8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc36Q8VBW8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Ttc36Q8VBW8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc36Q8VBW8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc36Q8VBW8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc36Q8VBW8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc36Q8VBW8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc36Q8VBW8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc36Q8VBW8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc36Q8VBW8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc36Q8VBW8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc36Q8VBW8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc36Q8VBW8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc36Q8VBW8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc36Q8VBW8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Ttc36Q8VBW8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc36Q8VBW8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc36Q8VBW8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc36Q8VBW8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc36Q8VBW8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc36Q8VBW8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc36Q8VBW8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Ttc36Q8VBW8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Ttc36Q8VBW8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Ttc36Q8VBW8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Ttc36Q8VBW8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Ttc36Q8VBW8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ttc36Q8VBW8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ttc36Q8VBW8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ttc36Q8VBW8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ttc36Q8VBW8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ttc36Q8VBW8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms