Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BbxQ8VBW5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BbxQ8VBW5 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms