Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Dnaaf4Q8R368 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Dnaaf4Q8R368 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Dnaaf4Q8R368 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Dnaaf4Q8R368 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dnaaf4Q8R368 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dnaaf4Q8R368 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dnaaf4Q8R368 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Dnaaf4Q8R368 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dnaaf4Q8R368 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dnaaf4Q8R368 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dnaaf4Q8R368 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dnaaf4Q8R368 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dnaaf4Q8R368 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dnaaf4Q8R368 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dnaaf4Q8R368 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dnaaf4Q8R368 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dnaaf4Q8R368 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dnaaf4Q8R368 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dnaaf4Q8R368 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dnaaf4Q8R368 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dnaaf4Q8R368 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dnaaf4Q8R368 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dnaaf4Q8R368 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dnaaf4Q8R368 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Dnaaf4Q8R368 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dnaaf4Q8R368 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dnaaf4Q8R368 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dnaaf4Q8R368 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dnaaf4Q8R368 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dnaaf4Q8R368 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dnaaf4Q8R368 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dnaaf4Q8R368 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dnaaf4Q8R368 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dnaaf4Q8R368 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dnaaf4Q8R368 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dnaaf4Q8R368 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dnaaf4Q8R368 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dnaaf4Q8R368 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Dnaaf4Q8R368 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Dnaaf4Q8R368 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Dnaaf4Q8R368 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Dnaaf4Q8R368 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Dnaaf4Q8R368 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Dnaaf4Q8R368 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Dnaaf4Q8R368 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Dnaaf4Q8R368 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Dnaaf4Q8R368 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Dnaaf4Q8R368 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Dnaaf4Q8R368 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Dnaaf4Q8R368 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Dnaaf4Q8R368 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Dnaaf4Q8R368 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Dnaaf4Q8R368 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Dnaaf4Q8R368 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Dnaaf4Q8R368 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dnaaf4Q8R368 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dnaaf4Q8R368 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dnaaf4Q8R368 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dnaaf4Q8R368 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dnaaf4Q8R368 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dnaaf4Q8R368 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dnaaf4Q8R368 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dnaaf4Q8R368 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dnaaf4Q8R368 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dnaaf4Q8R368 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dnaaf4Q8R368 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dnaaf4Q8R368 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dnaaf4Q8R368 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dnaaf4Q8R368 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dnaaf4Q8R368 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dnaaf4Q8R368 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dnaaf4Q8R368 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Dnaaf4Q8R368 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dnaaf4Q8R368 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dnaaf4Q8R368 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dnaaf4Q8R368 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dnaaf4Q8R368 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dnaaf4Q8R368 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dnaaf4Q8R368 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dnaaf4Q8R368 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dnaaf4Q8R368 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Dnaaf4Q8R368 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dnaaf4Q8R368 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dnaaf4Q8R368 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dnaaf4Q8R368 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dnaaf4Q8R368 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dnaaf4Q8R368 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dnaaf4Q8R368 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dnaaf4Q8R368 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dnaaf4Q8R368 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dnaaf4Q8R368 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dnaaf4Q8R368 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dnaaf4Q8R368 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Dnaaf4Q8R368 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dnaaf4Q8R368 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dnaaf4Q8R368 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dnaaf4Q8R368 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dnaaf4Q8R368 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dnaaf4Q8R368 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms