Protein–RNA interactions for Protein: Q8R323

Rfc3, Replication factor C subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc3Q8R323 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfc3Q8R323 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms