Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2G6

Ccdc80, Coiled-coil domain-containing protein 80, mousemouse

Predictions only

Length 949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc80Q8R2G6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc80Q8R2G6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms