Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sf3b4Q8QZY9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms