Protein–RNA interactions for Protein: Q8K558

Treml1, Trem-like transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml1Q8K558 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms